Contrariamente a lo que creía recordar, "Hot deck" != LOCF
Imputación (que es algo en lo que muy a regañadientes estoy trabajando estos días).
Si de verdad tienes que imputar datos en una tabla (y solo en ese caso), solo hay un criterio: construye un modelo para predecir los valores faltantes en función del resto y reemplaza el NA por la su predicción.
El modelo puede ser tan tonto como
lm(my_col ~ 1, na.rm = T)
que resulta en la popular estrategia de reemplazar los NAs por la media del resto de las observaciones.